毎年8月下旬～9月上旬ごろに、参道や境内地に約５００株の赤紫色や白色、ピンク色などの萩、13種類が咲き誇ります。萩の起こりは、室町幕府の初代将軍足利尊氏が、弟の直義との和睦の際、神照寺に仮泊した時、その記念に庭の隅に植えたと伝わっています。秋の風に吹かれて、小さな花弁を付けた細い萩の枝がさわさわと揺れる様は、心を癒す趣があります。