園内には15種3,000株のコスモスを植栽しています。最近は品種改良が進み、黄色い花や八重咲、筒咲きの花などが登場しています。

ガーデンミュージアム比叡には、40年前に東京大学インド植物調査隊が持ち帰った種子から育てた西洋シャクナゲ、京都・大原の山中に自生していたホンシャクナゲなどがあります。

園内には120種1500株のバラを植えています。標高が高く、冷涼な気候のため、夏の間も花を楽しむ事ができます。

ひまわりは7月中旬頃から8月中旬頃まで楽しめます。

ジヴェルニーのモネ邸宅の池をイメージして造られた庭園に睡蓮の花が咲き誇ります。