総持寺は滋賀県一のボタン寺として名高く、境内一面に植えられた牡丹は約80種類1000株。
冬の積雪に耐えて鮮やかに咲く花は、例年4月下旬から5月上旬が見ごろです。 牡丹が終わるころには、芍薬が花を咲かせます。
仁王門をくぐり、石畳を進むと広い境内の奥に本堂が見えます。お堂の中には聖観音（重要文化財）をはじめ、たくさんの仏像がまつられています。ご本尊は薬師如来様で、西国薬師霊場31番札所となっています。
またこのお寺は、すぐ近くで生まれた小堀遠州と縁が深く、県名勝指定の遠州流庭園（江戸初期、池泉回遊式庭園）があります。
本堂前庭には、梅の木を宿に松の木が育つ「松梅の木」があり、商売繁盛、良縁などのご利益があるそうです。
庭園・仏像の拝観は予約制です。
（牡丹は境内に咲いており、予約の必要はありません）